Слово пробегать может употребляться в 2-х разных значениях:
I. пробе́гать — провести время, бегая
В слове «пробегать» ударение падает на слог с буквой Е — пробЕгать.
II. пробега́ть — глагол
В упомянутом выше варианте ударение должно быть поставлено на слог с буквой А — пробегАть.